RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 GCNAQ96QF7 691 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ECI2O75521 394 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ASGR2P07307 311 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CCDC192P0DO97 292 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MYL4P12829 197 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CEBPBP17676 345 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CYP2F1P24903 491 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 WEE1P30291 646 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PCED1BQ96HM7 432 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MYRFLQ96LU7 910 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ATP2C2O75185 946 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MOSPD3O75425 235 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SOAT2O75908 522 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 NOL4O94818 638 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SRFP11831 508 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ANXA13P27216 316 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CCR2P41597 374 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CDH8P55286 799 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CYP27A1Q02318 531 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 C8orf48Q96LL4 319 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 NME7Q9Y5B8 376 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 HCRTO43612 131 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 GABRR2P28476 465 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 FMO5P49326 533 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 NLRP12P59046 1061 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CBWD6Q4V339 395 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ING5Q8WYH8 240 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SMARCD2Q92925 531 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ASB16Q96NS5 453 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SDCBP2Q9H190 292 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PRU2 124 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TMEM221A6NGB7 291 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 M0R296 226 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 BDNFP23560 247 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 GRIK1P39086 918 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 STX17P56962 302 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 PARM1Q6UWI2 310 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 GAREM2Q75VX8 874 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 GPT2Q8TD30 523 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 GIPC2Q8TF65 315 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 SEMA4DQ92854 862 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 FGF14Q92915 247 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TASP1Q9H6P5 420 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 IL21Q9HBE4 155 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 WNT16Q9UBV4 365 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-203ENST00000474160 TECTAO75443 2155 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 CILPO75339 1184 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PFKLP17858 780 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 RAP1GAPP47736 663 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PPP3CCP48454 512 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 NDST1P52848 882 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PFKPQ01813 784 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 TEAD2Q15562 447 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DDR2Q16832 855 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ASIC4Q96FT7 647 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 OBP2AQ9NY56 170 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-203ENST00000474160 PTPRDP23468 1912 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms