RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 NR4A1P22736 598 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ACVR2AP27037 513 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CD6P30203 668 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TECP42680 631 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 VAV2P52735 878 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PRKAG1P54619 331 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 GRM1Q13255 1194 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBB3Q13509 450 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 GORABQ5T7V8 394 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC46Q96FV0 321 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 NELL2Q99435 816 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CDC23Q9UJX2 597 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 FZD1Q9UP38 647 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.82□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 UNC119BA6NIH7 251 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 H7C4K7 107 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PEX11BO96011 259 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MYL4P12829 197 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TPH1P17752 444 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 HSPA7P48741 367 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CPT1AP50416 773 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 GUCY1B3Q02153 619 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TNFAIP2Q03169 654 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 E2F2Q14209 437 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 FANCBQ8NB91 859 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 POF1BQ8WVV4 589 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 HAS1Q92839 578 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ADAM2Q99965 735 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 INTS13Q9NVM9 706 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CLCA1A8K7I4 914 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 RGS10O43665 173 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 SPDEFO95238 335 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 RASAL1O95294 804 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 A1BGP04217 495 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 GATA3P23771 443 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PTGS2P35354 604 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 DGKEP52429 567 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ITGA8P53708 1063 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MYO1EQ12965 1108 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 STARD3Q14849 445 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MPEG1Q2M385 716 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 CRB3Q9BUF7 120 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 ADAMTS3O15072 1205 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 LPXNO60711 386 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNA3P22001 575 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 DGCR2P98153 550 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXE3Q13461 319 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TP53BP2Q13625 1128 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBA3CQ13748 450 aa5.79□□□□□ -1.48
PRPF40A-208ENST00000472760 NPY5RQ15761 445 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms