RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	VAV2	P52735	878 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	NLRP5	P59047	1200 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CSRP2	Q16527	193 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ALS2CL	Q60I27	953 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA1328	Q86T90	577 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	P2RX5	Q93086	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM107B	Q9H098	131 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SH2D4A	Q9H788	454 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CEP72	Q9P209	647 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	FLT1	P17948	1338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	BCL9	O00512	1426 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PP2D1	A8MPX8	630 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	EPHB6	O15197	1021 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT86	O43790	486 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	NMT2	O60551	498 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MOCS3	O95396	460 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MYB	P10242	640 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	COL6A2	P12110	1019 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT4	P19013	534 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PRPH	P41219	470 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GNGT1	P63211	74 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CHRND	Q07001	517 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GBP6	Q6ZN66	633 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CERS3	Q8IU89	383 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CD302	Q8IX05	232 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	BLID	Q8IZY5	108 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	IQCK	Q8N0W5	287 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CNPY4	Q8N129	248 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	C1orf159	Q96HA4	380 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GDF3	Q9NR23	364 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TAF1	P21675	1872 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MYH10	P35580	1976 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	BICDL2	A1A5D9	508 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	PSMA7	O14818	248 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	OPA1	O60313	960 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	MSC	O60682	206 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TACC1	O75410	805 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	CYP2D6	P10635	497 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	IDE	P14735	1019 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SUMO1-210	ENST00000469034	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58

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