RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 MESP2Q0VG99 397 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 RUFY3Q7L099 469 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ATP2A3Q93084 1043 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CRELD1Q96HD1 420 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 IFT74Q96LB3 600 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 MYRFLQ96LU7 910 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CAMK1GQ96NX5 476 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SLC22A12Q96S37 553 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM206Q9H813 350 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CD248Q9HCU0 757 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 GCNT4Q9P109 453 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ANO9A1A5B4 782 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CPLX1O14810 134 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ADAM23O75077 832 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TOM1L1O75674 476 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CXCL8P10145 99 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 PAX3P23760 479 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ZXDBP98169 803 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SCRN1Q12765 414 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SMARCB1Q12824 385 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 BFSP1Q12934 665 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 NBR1Q14596 966 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.629e-10■□□□□ 10.8
LAMC1-202ENST00000466964 VEPH1Q14D04 833 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 WHAMMQ8TF30 809 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 SENP8Q96LD8 212 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 GCNAQ96QF7 691 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-202ENST00000466964 MYH11P35749 1972 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SGK1O00141 431 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PIRO00625 290 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SH3BP5O60239 455 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 NOL4O94818 638 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PSMA5P28066 241 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SEZ6Q53EL9 994 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 C2orf27AQ580R0 203 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SPATA1Q5VX52 437 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 USP37Q86T82 979 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 GIPC2Q8TF65 315 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.14□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 TCHHQ07283 1943 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SEC24BO95487 1268 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 CLTAP09496 248 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 ODC1P11926 461 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 KRT2P35908 639 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 GUCY2FP51841 1108 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PEX3P56589 373 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SPAG1Q07617 926 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 ZPBP2Q6X784 338 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 NAXDQ8IW45 347 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 LRRC15Q8TF66 581 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-202ENST00000466964 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms