RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ACOT1	Q86TX2	421 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PSMG2	Q969U7	264 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GJA1	P17302	382 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CEBPB	P17676	345 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GRIK1	P39086	918 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	KCNH2	Q12809	1159 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	STKLD1	Q8NE28	680 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	TATDN2	Q93075	761 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MED15	Q96RN5	788 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	BCO2	Q9BYV7	579 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ANXA13	P27216	316 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CCR2	P41597	374 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	PTPN21	Q16825	1174 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	UNC93A	Q86WB7	457 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		18.9	■□□□□ 0.62
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRU2	124 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CLDN5	O00501	218 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	GABRR2	P28476	465 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA11	P43364	429 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ZXDA	P98168	799 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	VSTM1	Q6UX27	236 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	KCNK12	Q9HB15	430 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ANO10	Q9NW15	660 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ATP8B3	O60423	1300 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TECTA	O75443	2155 aa		18.89	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	FGF19	O95750	216 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CSH1	P0DML2	217 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CSH2	P0DML3	217 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	EPHA5	P54756	1037 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	MTMR3	Q13615	1198 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TEAD2	Q15562	447 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	STX1A	Q16623	288 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ZNF394	Q53GI3	561 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ARID3A	Q99856	593 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	THAP9	Q9H5L6	903 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CISH	Q9NSE2	258 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	GDE1	Q9NZC3	331 aa		18.88	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TRIM66	O15016	1216 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	P4HA2	O15460	535 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CCDC130	P13994	396 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	INCA1	Q0VD86	236 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CUL2	Q13617	745 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	MTSS1L	Q765P7	747 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	TTC39C	Q8N584	583 aa		18.87	■□□□□ 0.61
USP19-210	ENST00000465902	C12orf29	Q8N999	325 aa		18.87	■□□□□ 0.61

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