RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 INCA1Q0VD86 236 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MYO1EQ12965 1108 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TFDP2Q14188 446 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF394Q53GI3 561 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 VSTM1Q6UX27 236 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF410Q86VK4 478 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 XYLT1Q86Y38 959 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CFAP73A6NFT4 308 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 LACTBL1A8MY62 500 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ADM5C9JUS6 153 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SGK1O00141 431 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 STRNO43815 780 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SNX3O60493 162 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 LRCH4O75427 683 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TOMM70O94826 608 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 APOC2P02655 101 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CXCL8P10145 99 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PLCB3Q01970 1234 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SNAPC2Q13487 334 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 LLGL1Q15334 1064 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 C4orf22Q6V702 233 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM50Q86XT4 487 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 USP6NLQ92738 828 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CDCA5Q96FF9 252 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SIX4Q9UIU6 781 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SBF1O95248 1867 aa16.5■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF487B1APH4 448 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 LGALS2P05162 132 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SCTRP47872 440 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ARHGAP1Q07960 439 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 XRCC4Q13426 336 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MOGSQ13724 837 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MAML1Q92585 1016 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CNPY3Q9BT09 278 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CFAP69A5D8W1 941 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 RASA4BC9J798 803 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 GPR25O00155 361 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MCF2LO15068 1137 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 RASA4O43374 803 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 SPAG6O75602 509 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MICAL2O94851 1124 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ITGB3P05106 788 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 INSRRP14616 1297 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CLCN3P51790 818 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ACVR2BQ13705 512 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PDK2Q15119 407 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 HIF1AQ16665 826 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 AMHR2Q16671 573 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 JADE1Q6IE81 842 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ARMCX2Q7L311 632 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 KCTD6Q8NC69 237 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 OPTNQ96CV9 577 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 HPDLQ96IR7 371 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 ACAP3Q96P50 834 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.48■□□□□ 0.23
SUCLG2-202ENST00000460567 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms