RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 GAREM2Q75VX8 874 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 PCED1BQ96HM7 432 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 SDCBP2Q9H190 292 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 PTPRDP23468 1912 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 TRIOO75962 3097 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CSH1P0DML2 217 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 CSH2P0DML3 217 aa22.12■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 MAGEA11P43364 429 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 ASPAP45381 313 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 STX17P56962 302 aa22.12■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 STKLD1Q8NE28 680 aa22.12■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 GCNAQ96QF7 691 aa22.12■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.12■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 CFHP08603 1231 aa22.11■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 VSTM1Q6UX27 236 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.11■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.11■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.11■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.11■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VARS-218ENST00000459667 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.11■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 CBWD6Q4V339 395 aa22.1■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.09■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.08■■□□□ 1.13
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VARS-218ENST00000459667 WDR44Q5JSH3 913 aa22.07■■□□□ 1.12
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VARS-218ENST00000459667 SPATA17Q96L03 361 aa22.07■■□□□ 1.12
VARS-218ENST00000459667 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.07■■□□□ 1.12
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