RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454001.1

RPSAP54-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP54, Length 886 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP54-201ENST00000454001 FOXQ1Q9C009 403 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 EPC1Q9H2F5 836 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 CHST7Q9NS84 486 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DPP7Q9UHL4 492 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 TBX20Q9UMR3 447 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SNX12Q9UMY4 172 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 R4GN57 208 aa9.01□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 A0A1B0GUA9 196 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 CCDC169A6NNP5 214 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PROB1E7EW31 1015 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 F8VZ95 297 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 I3L4J1 428 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PTGESO14684 152 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PMM2O15305 246 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 GFPT2O94808 682 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PRKCBP05771 671 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 C8AP07357 584 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SRFP11831 508 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PRLRP16471 622 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 FERP16591 822 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 FSHRP23945 695 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SOX5P35711 763 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 STAT1P42224 750 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 VAMP7P51809 220 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SMTNP53814 917 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PTK2Q05397 1052 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 TUSC3Q13454 348 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 HTR4Q13639 388 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 NAB2Q15742 525 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PSMD5Q16401 504 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 C10orf76Q5T2E6 689 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 LIN9Q5TKA1 542 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 EEF1DP3Q658K8 133 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 RDH13Q8NBN7 331 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 LMO3Q8TAP4 145 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ING5Q8WYH8 240 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 KCNN1Q92952 543 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 NOX5Q96PH1 765 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 RTP3Q9BQQ7 232 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PARD6BQ9BYG5 372 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PRKD2Q9BZL6 878 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 GPR88Q9GZN0 384 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 KMT5AQ9NQR1 393 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 FAM53CQ9NYF3 392 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 RAB21Q9UL25 225 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 CACNA1AO00555 2505 aa9□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PATJQ8NI35 1801 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 H0YCG3 227 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SRGAP2O75044 1071 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 LRRN2O75325 713 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ZMYND10O75800 440 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ADRB2P07550 413 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 LAMP2P13473 410 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ADSSP30520 456 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DLG4P78352 724 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PPP3CAQ08209 521 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 PARM1Q6UWI2 310 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 DEPTORQ8TB45 409 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.99□□□□□ -0.97
RPSAP54-201ENST00000454001 FGF14Q92915 247 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms