RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 DDR2Q16832 855 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 OSTM1Q86WC4 334 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SIX4Q9UIU6 781 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.37■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GABRDO14764 452 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ATG13O75143 517 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 EGFP01133 1207 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 TXLNAP40222 546 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MYL7Q01449 175 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RESTQ13127 1097 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ALCAMQ13740 583 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PDGFRLQ15198 375 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC142Q17RM4 750 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PPM1JQ5JR12 505 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 LOXL4Q96JB6 756 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RNF40O75150 1001 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PDCP20941 246 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RAP1GAPP47736 663 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 AMPD2Q01433 879 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 USP4Q13107 963 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MTF1Q14872 753 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF77Q15935 545 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC22A12Q96S37 553 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM206Q9H813 350 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.35■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 A0A087X0B3 334 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 HCRTO43612 131 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 AKAP3O75969 853 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 EPN2O95208 641 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 IDEP14735 1019 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 DRD1P21728 446 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GJA4P35212 333 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 LHX1P48742 406 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 RBP5P82980 135 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 KBTBD6Q86V97 674 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.34■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 KRT19P08727 400 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PCSK1P29120 753 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 MAGEA11P43364 429 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GALK1P51570 392 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 LIMK1P53667 647 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FBXO43Q4G163 708 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 FAM171BQ6P995 826 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CPA6Q8N4T0 437 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 ECT2Q9H8V3 914 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 PANK4Q9NVE7 773 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 GCNT4Q9P109 453 aa21.33■■□□□ 1.01
GCSHP5-201ENST00000443090 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPRJQ12913 1337 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 PTPRDP23468 1912 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 AXIN1O15169 862 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 USP17L7P0C7H9 530 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF806P0C7X5 589 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 STAT6P42226 847 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 GPD1LQ8N335 351 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GCSHP5-201ENST00000443090 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms