RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MYO1EQ12965 1108 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CUL4BQ13620 913 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ATL3Q6DD88 541 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 DCLK2Q8N568 766 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RDH13Q8NBN7 331 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RUBCNQ92622 972 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MYRFLQ96LU7 910 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PLCB2Q00722 1185 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CYP24A1Q07973 514 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PSMD6Q15008 389 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TXNDC8Q6A555 127 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CGRRF1Q99675 332 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SYT15Q9BQS2 421 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 EPC1Q9H2F5 836 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 NME7Q9Y5B8 376 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PTPRDP23468 1912 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SOBPA7XYQ1 873 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 AFMP43652 599 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CYP2J2P51589 502 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SATB1Q01826 763 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 Q6ZS52 159 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MON1AQ86VX9 555 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CHFRQ96EP1 664 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 HPS4Q9NQG7 708 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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HLA-B-250ENST00000434333 AVPR1AP37288 418 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MAGEA11P43364 429 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CCR3P51677 355 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PON2Q15165 354 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF516Q92618 1163 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MYLPFQ96A32 169 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 GKN1Q9NS71 199 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TDP1Q9NUW8 608 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CDH9Q9ULB4 789 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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HLA-B-250ENST00000434333 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 TNNI1P19237 187 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ID4P47928 161 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CCINQ13939 588 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC32Q14392 662 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 FNBP1Q96RU3 617 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SLC22A12Q96S37 553 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 CFAP45Q9UL16 551 aa21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HLA-B-250ENST00000434333 SLFN14P0C7P3 912 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-250ENST00000434333 CXCL12P48061 93 aa21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-250ENST00000434333 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HLA-B-250ENST00000434333 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.51■■□□□ 1.03
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