RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 GABRDO14764 452 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 POMCP01189 267 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FAM163BP0C2L3 166 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GJA8P48165 433 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FAM189BP81408 668 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 FUT8Q9BYC5 575 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SNX25Q9H3E2 840 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GPC1-202ENST00000420138 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 NBNO60934 754 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SASH3O75995 380 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PLA2G4AP47712 749 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TAS2R40P59535 323 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TAP1Q03518 808 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 WSCD1Q658N2 575 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SENP8Q96LD8 212 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.14■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GABBR2O75899 941 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 RWDD2BP57060 319 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GRIK3Q13003 919 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 BFSP2Q13515 415 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PMF1Q6P1K2 205 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KRIT1O00522 736 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CCDC130P13994 396 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KRT12Q99456 494 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.13■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KRT3P12035 628 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CCDC142Q17RM4 750 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.12■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 E5RJQ4 531 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 F8VP50 259 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ATP2C2O75185 946 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ZMYND10O75800 440 aa22.11■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 TCF4P15884 667 aa22.11■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 SLC7A5Q01650 507 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PDE4CQ08493 712 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 HDXQ7Z353 690 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TMEM110Q86TL2 294 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SYNCQ9H7C4 482 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CCDC188H7C350 402 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PITPNM1O00562 1244 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 MAP2K7O14733 419 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 COL6A1P12109 1028 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 TUSC3Q13454 348 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 C8orf74Q6P047 294 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 STK32AQ8WU08 396 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ST7Q9NRC1 585 aa22.1■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.1■■□□□ 1.13
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GPC1-202ENST00000420138 PSTPIP1O43586 416 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 B4GALT3O60512 393 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 RGS7P49802 495 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.1■■□□□ 1.13
GPC1-202ENST00000420138 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.1■■□□□ 1.13
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