RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ATL2Q8NHH9 583 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 PTPRN2Q92932 1015 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 CEP170P1Q96L14 293 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DEFB118Q96PH6 123 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SAR1AQ9NR31 198 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAMENP-202ENST00000419303 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD62A6NC57 917 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 COL6A1P12109 1028 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 INSRRP14616 1297 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CREB1P16220 341 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ITIH2P19823 946 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 EPHB2P29323 1055 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SOX5P35711 763 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CAV1Q03135 178 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GIT2Q14161 759 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CYP1B1Q16678 543 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 XKR9Q5GH70 373 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TTC27Q6P3X3 843 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GPBP1Q86WP2 473 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 UCMAQ8WVF2 138 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SIX2Q9NPC8 291 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CHKBQ9Y259 395 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 KBTBD13C9JR72 458 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 MAP3K7O43318 606 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ACSL3O95573 720 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ECEL1O95672 775 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TTC4O95801 387 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 MYBL1P10243 752 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 FOXN2P32314 431 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 POU5F1BQ06416 359 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC34A1Q06495 639 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 AP1B1Q10567 949 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 NR1H3Q13133 447 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 MPP2Q14168 576 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SNX17Q15036 470 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GRIK4Q16099 956 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 HHATQ5VTY9 493 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CXCL17Q6UXB2 119 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 DAW1Q8N136 415 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ALG3Q92685 438 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 STK33Q9BYT3 514 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ALG6Q9Y672 507 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PQY0 241 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 COQ9O75208 318 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ENTPD5O75356 428 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TJP3O95049 919 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ZWINTO95229 277 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 T-ENOLP0DO92 83 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 PYGBP11216 843 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GAP43P17677 238 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ABCB4P21439 1286 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 GSTT1P30711 240 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 ARL2P36404 184 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 CDK7P50613 346 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 TCEAL1Q15170 157 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 IER5Q5VY09 327 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAMENP-202ENST00000419303 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms