RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 TTC39CQ8N584 583 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 UBR7Q8N806 425 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 MAGEA11P43364 429 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ALDH1A3P47895 512 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 EPHB3P54753 998 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 NTHL1P78549 312 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 GCNT1Q02742 428 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ZP2Q05996 745 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ELMOD1Q8N336 334 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-202ENST00000406506 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 IQCB1Q15051 598 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 KAT5Q92993 513 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 MUC3AQ02505 3323 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SMTNL1A8MU46 457 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 RHOP08100 348 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ATP1A3P13637 1013 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PTPN2P17706 415 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SLC9A1P19634 815 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 BDNFP23560 247 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 GPR15P49685 360 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 VEPH1Q14D04 833 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF394Q53GI3 561 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 VSTM1Q6UX27 236 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 RRAGAQ7L523 313 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 FAM35AQ86V20 835 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PSMG2Q969U7 264 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CORO1BQ9BR76 489 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 VPS16Q9H269 839 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CBX8Q9HC52 389 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ASB3Q9Y575 518 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ATP8B3O60423 1300 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 MYO10Q9HD67 2058 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CLDN5O00501 218 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CAVIN2O95810 425 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 TPM2P07951 284 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC130P13994 396 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PON1P27169 355 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 RAD23BP54727 409 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 APBA1Q02410 837 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 DDR2Q16832 855 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 IQCEQ6IPM2 695 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ITIH5Q86UX2 942 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 FUKQ8N0W3 1084 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 C12orf29Q8N999 325 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 GPR152Q8TDT2 470 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SIX2Q9NPC8 291 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 ASAH2Q9NR71 780 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 BECN2A8MW95 431 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 FSHRP23945 695 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 CACNA2D1P54289 1103 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 EPHA5P54756 1037 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 GJB7Q6PEY0 223 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 TMC8Q8IU68 726 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 STKLD1Q8NE28 680 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-202ENST00000406506 GIPC2Q8TF65 315 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms