RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 IRAK3Q9Y616 596 aa29.95■■■□□ 2.39
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GIPC1-202ENST00000393028 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 FUKQ8N0W3 1084 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 PANX2Q96RD6 677 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.94■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.94■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 CHRNB2P17787 502 aa29.93■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 ARHGAP17Q68EM7 881 aa29.93■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 FAM35AQ86V20 835 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 FAM170AA1A519 330 aa29.93■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 GPR17Q13304 367 aa29.93■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 TTC9BQ8N6N2 239 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 CHP1Q99653 195 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 CDR2Q01850 454 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 RAB33AQ14088 237 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 SYT11Q9BT88 431 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 KRT82Q9NSB4 513 aa29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 M0QYV0 167 aa29.91■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 ADH1AP07327 375 aa29.91■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 GRIN2CQ14957 1233 aa29.91■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 UBA3Q8TBC4 463 aa29.9■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-202ENST00000393028 CYP2F1P24903 491 aa29.89■■■□□ 2.38
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GIPC1-202ENST00000393028 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-202ENST00000393028 AP1G2O75843 785 aa29.87■■■□□ 2.37
GIPC1-202ENST00000393028 SOAT2O75908 522 aa29.87■■■□□ 2.37
GIPC1-202ENST00000393028 FAM200BP0CF97 657 aa29.87■■■□□ 2.37
GIPC1-202ENST00000393028 SMARCD1Q96GM5 515 aa29.87■■■□□ 2.37
GIPC1-202ENST00000393028 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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