RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373193.7

PTPRT-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRT, Length 12,681 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-205ENST00000373193 USP17L22D6RA61 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 USP17L19D6RCP7 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 USP17L20D6RJB6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 MED26O95402 600 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 ALDH1B1P30837 517 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 PHKA2P46019 1235 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 HSD17B4P51659 736 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 USP17L24Q0WX57 530 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 UBE3CQ15386 1083 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 MAPK6Q16659 721 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 HEATR9A2RTY3 570 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 MACC1Q6ZN28 852 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 KAT2BQ92831 832 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 ERBB3P21860 1342 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 HS6ST1O60243 411 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 ATG7O95352 703 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 RAG1P15918 1043 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 ERAP2Q6P179 960 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 RNF112Q9ULX5 631 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 PDE9AO76083 593 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 HOXB7P09629 217 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-205ENST00000373193 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 CASP5P51878 434 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 CDC73Q6P1J9 531 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 GPR1P46091 355 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 AQP5P55064 265 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ADRM1Q16186 407 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 FAM228AQ86W67 206 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 OSBP2Q969R2 916 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 FGFR2P21802 821 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 RASA2Q15283 850 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TAB1Q15750 504 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 KRT20P35900 424 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TXNRD1Q16881 649 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 SEMA4DQ92854 862 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PCNAP12004 261 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 RHAGQ02094 409 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 C8orf4Q9NR00 106 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 CCDC182A6NF36 153 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 E7ENQ6 273 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 MAGEB18Q96M61 343 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 JAK3P52333 1124 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PROSER3Q2NL68 480 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 LGR5O75473 907 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 MT-CO1P00395 513 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 GPRASP2Q96D09 838 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PIGUQ9H490 435 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 VAV3Q9UKW4 847 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 CCDC130P13994 396 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 IFNAR1P17181 557 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 STARP49675 285 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TNFAIP2Q03169 654 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 TRAF3Q13114 568 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 ATP10DQ9P241 1426 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-205ENST00000373193 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms