RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC89Q8N998 374 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 FAM20AQ96MK3 541 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 PIGSQ96S52 555 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 AGPAT1Q99943 283 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 SYT11Q9BT88 431 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 WDR18Q9BV38 432 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 TIPINQ9BVW5 301 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 MIS12Q9H081 205 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 KCND2Q9NZV8 630 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.59□□□□□ -1.19
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CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-201ENST00000372616 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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CTPS1-201ENST00000372616 AKAP3O75969 853 aa7.58□□□□□ -1.2
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CTPS1-201ENST00000372616 ATF2P15336 505 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB4P21439 1286 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FMO5P49326 533 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 STAT2P52630 851 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CDR2Q01850 454 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTK6Q13882 451 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RAB33AQ14088 237 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD1Q719H9 257 aa7.58□□□□□ -1.2
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CTPS1-201ENST00000372616 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.58□□□□□ -1.2
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CTPS1-201ENST00000372616 MGARPQ8TDB4 240 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KIFAP3Q92845 792 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 STMN2Q93045 179 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FGD4Q96M96 766 aa7.58□□□□□ -1.2
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CTPS1-201ENST00000372616 HHIPQ96QV1 700 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 WRNIP1Q96S55 665 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HCSTQ9UBK5 93 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FEM1BQ9UK73 627 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 POTECB2RU33 542 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf81C9J6K1 198 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C2CD2LO14523 706 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SPOPO43791 374 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC3O60645 756 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MMP20O60882 483 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PAGE1O75459 146 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TAC1P20366 129 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CETN2P41208 172 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PSMC4P43686 418 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 JAG1P78504 1218 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ALCAMQ13740 583 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LAMB3Q13751 1172 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GIT2Q14161 759 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PDK4Q16654 411 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LONRF1Q17RB8 773 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GNPTABQ3T906 1256 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SGO2Q562F6 1265 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PHC3Q8NDX5 983 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FAM13CQ8NE31 585 aa7.57□□□□□ -1.2
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