RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MROH9Q5TGP6 573 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FLOT2Q14254 428 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 WDR93Q6P2C0 686 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CD274Q9NZQ7 290 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CDYLQ9Y232 598 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 LONP2Q86WA8 852 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 NAT9Q9BTE0 207 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 B2RBV5 119 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 AP1G2O75843 785 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP3O75969 853 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SEC24CP53992 1094 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SREBF2Q12772 1141 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PDK2Q15119 407 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL16Q8N461 479 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 IFNEQ86WN2 208 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 THTPAQ9BU02 230 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KLK14Q9P0G3 267 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SUFUQ9UMX1 484 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RGS2P41220 211 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MED21Q13503 144 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 APOA4P06727 396 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 MCL1Q07820 350 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf87Q6PH81 154 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 NUP93Q8N1F7 819 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 GPR182O15218 404 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 IL1R1P14778 569 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PKN1Q16512 942 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 VCAM1P19320 739 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4AP47712 749 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AIM2O14862 343 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CHRM3P20309 590 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ERFP50548 548 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT1Q86TX2 421 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PMPCBO75439 489 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf58C9J3I9 102 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 F8VZ95 297 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ADCK2Q7Z695 626 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83AQ86UY5 434 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 EME1Q96AY2 570 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RRM1P23921 792 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 GEMP55040 296 aa21.07■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NFIBO00712 420 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 IRF1P10914 325 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RARGP13631 454 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 TGM2P21980 687 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 ETFBP38117 255 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SLC11A2P49281 568 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 GID8Q9NWU2 228 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 AGLP35573 1532 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.06■□□□□ 0.96
CCSAP-203ENST00000366687 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms