RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LTBP2Q14767 1821 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SMTNL1A8MU46 457 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3R2O00459 728 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS2O95450 1211 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KCNA2P16389 499 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KRT9P35527 623 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PSMB10P40306 273 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MLH1P40692 756 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.974e-9■■■■■ 32.8
CCSAP-202ENST00000366686 BFSP1Q12934 665 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.978e-7■■■■□ 24.4
CCSAP-202ENST00000366686 LSAMPQ13449 338 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PXKQ7Z7A4 578 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CREG2Q8IUH2 290 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 USHBP1Q8N6Y0 703 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FAM133AQ8N9E0 248 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 AVL9Q8NBF6 648 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF540Q8NDQ6 660 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CAGE1Q8TC20 777 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SUCLG2Q96I99 432 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KCND1Q9NSA2 647 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LRFN1Q9P244 771 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 VPS28Q9UK41 221 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ACSL6Q9UKU0 697 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ANK1P16157 1881 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM64A6NGJ6 449 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM64BA6NI03 449 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD11A6QL63 1104 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TMCO5BA8MYB1 307 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF10AO00220 468 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GHRHP01286 108 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ADH7P40394 386 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 POLD2P49005 469 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF131P52739 623 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RBP5P82980 135 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GAB4Q2WGN9 574 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MCTP1Q6DN14 999 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A7Q6PXP3 512 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZS46 218 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DAAM2Q86T65 1068 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MON1AQ86VX9 555 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 USP38Q8NB14 1042 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DTWD2Q8NBA8 298 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PANK1Q8TE04 598 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RGMAQ96B86 450 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MOAP1Q96BY2 351 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CORO1BQ9BR76 489 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD10Q9H3F6 313 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PNPLA6Q8IY17 1366 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQF6 199 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM82A0PJX8 343 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf72A4D263 438 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC14BA6NHZ5 514 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 H0YHG0 523 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SEC22BO75396 215 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NTSR2O95665 410 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD16AO95870 558 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IFNGR1P15260 489 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ABCD3P28288 659 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RDXP35241 583 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD6Q15008 389 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CRY1Q16526 586 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EP400NLQ6ZTU2 488 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SZRD1Q7Z422 152 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CRIPAKQ8N1N5 446 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PSMA8Q8TAA3 256 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KAT5Q92993 513 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GPAMQ9HCL2 828 aa2.75□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.74□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PARD3Q8TEW0 1356 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms