RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 APOA5Q6Q788 366 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT78Q8N1N4 520 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 NELL1Q92832 810 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 APIPQ96GX9 242 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SERHLQ9NQF3 203 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.841e-11■■■■■ 86.9
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TMX2Q9Y320 296 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 VWC2LB2RUY7 222 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ADM5C9JUS6 153 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 E9PLN8 166 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PMM2O15305 246 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PROM1O43490 865 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 INMTO95050 263 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 UNC5CO95185 931 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MYF5P13349 255 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 NPR1P16066 1061 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KLRC1P26715 233 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LOXL3P58215 753 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FPGSQ05932 587 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SEMA5AQ13591 1074 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 DYRK1AQ13627 763 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CNGA2Q16280 664 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 USP37Q86T82 979 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PDPRQ8NCN5 879 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 IL31RAQ8NI17 732 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SNX19Q92543 992 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXL20Q96IG2 436 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIB1Q96RU8 372 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 INTS13Q9NVM9 706 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 WIPF3A6NGB9 483 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CGB1A6NKQ9 187 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 A6NNZ2 444 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 E7ENX8 843 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 BTN3A1O00481 513 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MPPED1O15442 326 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIAP1O43715 76 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ORC4O43929 436 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CHRM2P08172 466 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP3CBP16298 524 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 VIPR2P41587 438 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 AK2P54819 239 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 WNT3P56703 355 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TAP2Q03519 686 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT17Q04695 432 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 BTKQ06187 659 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 IQCB1Q15051 598 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TXNRD1Q16881 649 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LONRF1Q17RB8 773 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 LONRF3Q496Y0 759 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 KAZNQ674X7 775 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 YAF2Q8IY57 180 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKS1AQ92625 1134 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 UROC1Q96N76 676 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD3E-201ENST00000362899 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms