RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 MARCH7Q9H992 704 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNED1Q8TER0 1413 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPAN1O60635 241 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL6A1P12109 1028 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 AKR1B1P15121 316 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANXA13P27216 316 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCB3Q01970 1234 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASIC2Q16515 512 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 BOLA3Q53S33 107 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC23LQ6PF05 361 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEX26Q7Z412 305 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITIH5Q86UX2 942 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPBP1Q86WP2 473 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAGEB18Q96M61 343 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 APPL1Q9UKG1 709 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.31□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLIC2O15247 247 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PJA2O43164 708 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 B4GALT4O60513 344 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT4P19013 534 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PON1P27169 355 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 IST1P53990 364 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP2B1P63010 937 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLUL1Q15846 466 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDONQ4KMG0 1287 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 IYDQ6PHW0 289 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 HAS1Q92839 578 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSKH2Q96QS6 385 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNX24Q9Y343 169 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERPING1P05155 500 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMC6P62333 389 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 COQ7Q99807 217 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAMB1P07942 1786 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCP4L1A6NKN8 68 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP17L10C9JJH3 530 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMD11O00231 422 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF12P17014 697 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RFC4P35249 363 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNH2Q12809 1159 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAB2Q15742 525 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 C4orf46Q504U0 113 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC6Q86X45 466 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ELMOD1Q8N336 334 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 THAP1Q9NVV9 213 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAS2R1Q9NYW7 299 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 NR2E1Q9Y466 385 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSPH10BP0C881 870 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCB4P21439 1286 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms