RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 PTK6Q13882 451 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 HIPK4Q8NE63 616 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MRIQ9BWK5 157 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.43■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 DDR1Q08345 913 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CDCA5Q96FF9 252 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A087WZ62 844 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 EPHB3P54753 998 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.42■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.42■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CARNS1A5YM72 827 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CENPCQ03188 943 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 PGM5Q15124 567 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATA21Q7Z572 469 aa21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SASH3O75995 380 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATA17Q96L03 361 aa21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 WWP1Q9H0M0 922 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ITM2BQ9Y287 266 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SLIT1O75093 1534 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 NWD1Q149M9 1564 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 ADM5C9JUS6 153 aa21.41■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 PTGER2P43116 358 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 GRIK4Q16099 956 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.41■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MSCO60682 206 aa21.4■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 SETD4Q9NVD3 440 aa21.4■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.4■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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NCKAP1-201ENST00000360982 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TRABDQ9H4I3 376 aa21.4■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 IQGAP1P46940 1657 aa21.4■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.39■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.39■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 RSPH10BP0C881 870 aa21.39■■□□□ 1.02
NCKAP1-201ENST00000360982 MCF2P10911 925 aa21.39■■□□□ 1.02
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