RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 CLDN10P78369 228 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ILDR2Q71H61 639 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RNF39Q9H2S5 420 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PARP14Q460N5 1801 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TREHO43280 583 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 LCP1P13796 627 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HSPA6P17066 643 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 NPNTQ6UXI9 565 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 LCTP09848 1927 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 E5RJQ4 531 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TSPAN1O60635 241 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MMP3P08254 477 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FAXCQ5TGI0 409 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RUBCNQ92622 972 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FAM81BQ96LP2 452 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 H0YGN5 161 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 IL1R2P27930 398 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GAD2Q05329 585 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PPP2R5EQ16537 467 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ATL2Q8NHH9 583 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 NFS1Q9Y697 457 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 A8MXQ7 604 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FSCN2O14926 492 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RNF8O76064 485 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PDGFRAP16234 1089 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SLC1A1P43005 524 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SKOR1P84550 965 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SURF1Q15526 300 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 QPCTQ16769 361 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PPTC7Q8NI37 304 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 NEBLO76041 1014 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PPP2R2AP63151 447 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PTP4A2Q12974 167 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TLK2Q86UE8 772 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SNF8Q96H20 258 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 GMNCA6NCL1 334 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MAGEB2O15479 319 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MTA2O94776 668 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PGK1P00558 417 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC130P13994 396 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FNTAP49354 379 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SNCBQ16143 134 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MREGQ8N565 214 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC89Q8N998 374 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MORC4Q8TE76 937 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 HTTP42858 3142 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM4-201ENST00000349062 RECQL4O94761 1208 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms