RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 FAM136AQ96C01 138 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 CTDNEP1O95476 244 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 RFX3P48380 749 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB4P48594 390 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 NCALDP61601 193 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ERP27Q96DN0 273 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 SYTL2Q9HCH5 934 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KLRC1P26715 233 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SLC11A2P49281 568 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CPA2P48052 419 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CENPCQ03188 943 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PWP1Q13610 501 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 OLFM3Q96PB7 478 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MANSC1Q9H8J5 431 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KRT87PA6NCN2 255 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 B3GAT3O94766 335 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM16O95361 564 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KCNT1Q5JUK3 1230 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KIF2CQ99661 725 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQJ5 194 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CAND2O75155 1236 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PLD3Q8IV08 490 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 USP31Q70CQ4 1352 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MED24O75448 989 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CYB561D2O14569 222 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GPR182O15218 404 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KRT34O76011 436 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO32Q969P5 355 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 IL17RAQ96F46 866 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PNKPQ96T60 521 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 F5H5T6 163 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM169Q96HH4 297 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 RAD18Q9NS91 495 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 WDR47O94967 919 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 USP38Q8NB14 1042 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 VPS50Q96JG6 964 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 AAASQ9NRG9 546 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ARP10275 920 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 NEK2P51955 445 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K7CLP57077 242 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 OOSP2Q86WS3 158 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MTFR1Q15390 333 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 JADE3Q92613 823 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CAP2P40123 477 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 BARGINQ6ZT62 677 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 E2F7Q96AV8 911 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TGM2P21980 687 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM60Q495X7 471 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CYTH3O43739 400 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GRB10Q13322 594 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC7Q99615 494 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 RNF112Q9ULX5 631 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 GUCA1CO95843 209 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 LZTS1Q9Y250 596 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 STAG3L1P0CL83 205 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ZIM3Q96PE6 472 aa23.23■■□□□ 1.31
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