RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 ANXA13P27216 316 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 HOXA9P31269 272 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 KLK7P49862 253 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 EPHB3P54753 998 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 APBA1Q02410 837 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 DUSP4Q13115 394 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 VEPH1Q14D04 833 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 PCED1BQ96HM7 432 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 PKMYT1Q99640 499 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 EHD2Q9NZN4 543 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 HESX1Q9UBX0 185 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 MYH10P35580 1976 aa14.96□□□□□ -0.01
CMTM1-201ENST00000328020 F8VZ95 297 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 HCRTO43612 131 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ZMYND10O75800 440 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 NOL4O94818 638 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FAM200BP0CF97 657 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 SOX5P35711 763 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 PBX1P40424 430 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF132P52740 706 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ORC1Q13415 861 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 TAF12Q16514 161 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CES5AQ6NT32 575 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ITIH5Q86UX2 942 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 PPM1EQ8WY54 764 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 TWNKQ96RR1 684 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 COG5Q9UP83 839 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ASB3Q9Y575 518 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.95□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1W2PQJ5 194 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 POU2F2P09086 479 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 BDNFP23560 247 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 GNA15P30679 374 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 GRIK1P39086 918 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 PDE6CP51160 858 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ITIH3Q06033 890 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 KCNC3Q14003 757 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 COL19A1Q14993 1142 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FAM35AQ86V20 835 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 VSTM4Q8IW00 320 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 C12orf29Q8N999 325 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 HLA-CQ95604 372 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CEP83Q9Y592 693 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 NME7Q9Y5B8 376 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 PLXNA3P51805 1871 aa14.94□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CYP26A1O43174 497 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 THAP12O43422 761 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 AP1G2O75843 785 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 SEC24AO95486 1093 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CCDC130P13994 396 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FERP16591 822 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CYP2F1P24903 491 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ADORA2BP29275 332 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 KRT9P35527 623 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF75DP51815 510 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 JAM2P57087 298 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ZBED6P86452 979 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 CNGA2Q16280 664 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 MEA1Q16626 185 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 FUKQ8N0W3 1084 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 C8orf48Q96LL4 319 aa14.93□□□□□ -0.02
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms