RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 DOCK1Q14185 1865 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 MCL1Q07820 350 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 WDR49Q8IV35 697 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PINK1-201ENST00000321556 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TMEM63AO94886 807 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ITGAVP06756 1048 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ASPAP45381 313 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 MOGSQ13724 837 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CCDC142Q17RM4 750 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NPNTQ6UXI9 565 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CPXM1Q96SM3 734 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TYROBPO43914 113 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.82■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TOM1L1O75674 476 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ALADP13716 330 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CCNB1P14635 433 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 MMRN1Q13201 1228 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PDK4Q16654 411 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 EBF2Q9HAK2 575 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CEP83Q9Y592 693 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NFKBIEO00221 500 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 MAP3K6O95382 1288 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PRKCBP05771 671 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 OAZ1P54368 228 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NLRP4Q96MN2 994 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TWNKQ96RR1 684 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PAFAH2Q99487 392 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CALN1Q9BXU9 219 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 FOXP3Q9BZS1 431 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SYNCQ9H7C4 482 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 GINM1Q9NU53 330 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SIP14410 1827 aa24.81■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ATP2A1O14983 1001 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 HOXC6P09630 235 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SETDB1Q15047 1291 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TREML2Q5T2D2 321 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 LRRC38Q5VT99 294 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 DCAF15Q66K64 600 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 RFX6Q8HWS3 928 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 ACVR2BQ13705 512 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NAA25Q14CX7 972 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 TDRPQ86YL5 185 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 PIM2Q9P1W9 311 aa24.8■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PINK1-201ENST00000321556 KDELR1P24390 212 aa24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms