RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 OPTNQ96CV9 577 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 FBXL18Q96ME1 805 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 SPATA33Q96N06 139 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 PLVAPQ9BX97 442 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 ASB3Q9Y575 518 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTC27-201ENST00000317907 CAPN9O14815 690 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TP73O15350 636 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 EXTL3O43909 919 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 KRT36O76013 467 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 PYGLP06737 847 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 HHATQ5VTY9 493 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RFX8Q6ZV50 586 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZNF365Q70YC5 407 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CHST13Q8NET6 341 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZNF333Q96JL9 665 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 GBP5Q96PP8 586 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 EPAS1Q99814 870 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RLFQ13129 1914 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MCM3APO60318 1980 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ATP2A1O14983 1001 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CACNA2D1P54289 1103 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CCNJLQ8IV13 435 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TRABDQ9H4I3 376 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CFAP69A5D8W1 941 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 P4HA2O15460 535 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RNF8O76064 485 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 KRT19P08727 400 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 PTPN4P29074 926 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 OVGP1Q12889 678 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MOGSQ13724 837 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 FYB2Q5VWT5 728 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RDM1Q8NG50 284 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SMC6Q96SB8 1091 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TIPINQ9BVW5 301 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 LRRC19Q9H756 370 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 NFASCO94856 1347 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 A0A0G2JND7 137 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ASMTLO95671 621 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MAPK4P31152 587 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ARL2P36404 184 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 PSMC4P43686 418 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 MYL6P60660 151 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZACNQ401N2 412 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RASIP1Q5U651 963 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 VPS52Q8N1B4 723 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 DNERQ8NFT8 737 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CDCA5Q96FF9 252 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 HTTP42858 3142 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 SOCS7O14512 581 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CNMDO75829 334 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 IQCF3P0C7M6 154 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 TCF4P15884 667 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 GARTP22102 1010 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 CDH8P55286 799 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC27-201ENST00000317907 ZBTB16Q05516 673 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms