RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LCHNA4D1U4 455 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 M0QYV0 167 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN5O00501 218 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADORA2BP29275 332 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELF2Q15723 593 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL23Q86XA0 190 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THAP2Q9H0W7 228 aa25.28■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH10P35580 1976 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBB4BP68371 445 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNGA2Q16280 664 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC30AQ86WT1 665 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD62A6NC57 917 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TULP2O00295 520 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MED7O43513 233 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTN2O75298 545 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM163BP0C2L3 166 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4Q2P0C623 313 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LINC00271P0C7V0 271 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GZMAP12544 262 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TYMPP19971 482 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RABGGTBP53611 331 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA1Q92805 767 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGSF21Q96ID5 467 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DSEQ9UL01 958 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCANO14594 1321 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC3O43617 180 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRGAP2O75044 1071 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAX3P23760 479 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTP2Q5QGT7 225 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNIP3Q96KP6 325 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLR10Q9BXR5 811 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTAGE8P0CG41 777 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CENPCQ03188 943 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHHQ15465 462 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASIP1Q5U651 963 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAQR9Q6ZVX9 377 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FUKQ8N0W3 1084 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF558Q96NG5 402 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.25■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFEMP2O95967 443 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FGFR3P22607 806 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RFFLQ8WZ73 363 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC9A7Q96T83 725 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH9Q9ULB4 789 aa25.24■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLL1O43897 1013 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYOGP15173 224 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPD2P43304 727 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NSFP46459 744 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPRED2Q7Z698 418 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCED1BQ96HM7 432 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PKMYT1Q99640 499 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACBD6Q9BR61 282 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INSL6Q9Y581 213 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3R2O00459 728 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYN3O14994 580 aa25.23■■□□□ 1.63
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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