RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 GCKP35557 465 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC3Q13217 504 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SPATA18Q8TC71 538 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GBP5Q96PP8 586 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PAFAH2Q99487 392 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MMP19Q99542 508 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NPHS2Q9NP85 383 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MYH4Q9Y623 1939 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 YDJCA8MPS7 323 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 DIAPH2O60879 1101 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PDGFRAP16234 1089 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GLRA2P23416 452 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MYL6P60660 151 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 METTL7BQ6UX53 244 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 Q9H521 79 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 COL20A1Q9P218 1284 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 FETUBQ9UGM5 382 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ATP9AO75110 1047 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PIGRP01833 764 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MX2P20592 715 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CNTFP26441 200 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PTPN7P35236 360 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SOX10P56693 466 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 RELL1Q8IUW5 271 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-201ENST00000264345 KAT2BQ92831 832 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACAP3Q96P50 834 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-201ENST00000264345 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-201ENST00000264345 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-201ENST00000264345 PNMA3Q9UL41 463 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 COL4A1P02462 1669 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-201ENST00000264345 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 MCF2P10911 925 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 KCNA2P16389 499 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 ACADSBP45954 432 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 GHRHRQ02643 423 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 PARP6Q2NL67 630 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-201ENST00000264345 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.25□□□□□ -0.93
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