RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 JAK1P23458 1154 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 CHRNB3Q05901 458 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 E9PBE3 544 aa16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 GRIN3BO60391 1043 aa16.68■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 USP33Q8TEY7 942 aa16.68■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.68■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 PNMA3Q9UL41 463 aa16.68■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 ARMCX1Q9P291 453 aa16.67■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 ISLR2Q6UXK2 745 aa16.67■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.262e-8■□□□□ 10.1
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CTIF-201ENST00000256413 PTPRN2Q92932 1015 aa16.67■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 C12orf60Q5U649 245 aa16.67■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 ALOX12P18054 663 aa16.66■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 FANCEQ9HB96 536 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 IDH3BO43837 385 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1G1O75348 118 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 COG2Q14746 738 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 DCAF4Q8WV16 495 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 USE1Q9NZ43 259 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.66■□□□□ 0.26
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CTIF-201ENST00000256413 ACAP1Q15027 740 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 KRT35Q92764 455 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 NCALDP61601 193 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 LXNQ9BS40 222 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.66■□□□□ 0.26
CTIF-201ENST00000256413 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
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