RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 LHX1P48742 406 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CBX1P83916 185 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 APBA1Q02410 837 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CUL2Q13617 745 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNC3Q14003 757 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAB33AQ14088 237 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 COL19A1Q14993 1142 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC142Q17RM4 750 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PALB2Q86YC2 1186 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 EFHBQ8N7U6 833 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP112Q8N8E3 955 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 GOLGA1Q92805 767 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KAT5Q92993 513 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SNX25Q9H3E2 840 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TGM5O43548 720 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TBX10O75333 385 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 LCA5LO95447 670 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 VNN2O95498 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM163BP0C2L3 166 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CD58P19256 250 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PON1P27169 355 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCSK1P29120 753 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDR1P51861 262 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT83P78385 493 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 INCA1Q0VD86 236 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNMA1Q12791 1236 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 LILRA6Q6PI73 481 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBR7Q8N806 425 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 BAP1Q92560 729 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PGLYRP2Q96PD5 576 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PKMYT1Q99640 499 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYT15Q9BQS2 421 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ACBD6Q9BR61 282 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIX2Q9NPC8 291 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLDND1Q9NY35 253 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDH9Q9ULB4 789 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTMR11A4FU01 709 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 A8MXQ7 604 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 EPHB6O15197 1021 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP8B1O43520 1251 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP2C2O75185 946 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 CILPO75339 1184 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ABLIM3O94929 683 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PDGFRBP09619 1106 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPATA31D3P0C874 917 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 NDST1P52848 882 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TUBB4BP68371 445 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSPY1Q01534 308 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 GCNT1Q02742 428 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPR17Q13304 367 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ORC1Q13415 861 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADAM15Q13444 863 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TEX35Q5T0J7 233 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 GJB7Q6PEY0 223 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 RRAGAQ7L523 313 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT222Q8N1A0 295 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 WHAMMQ8TF30 809 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 TWNKQ96RR1 684 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAMEF10-201ENST00000235347 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms