RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lhx5P61375 402 aa13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Creb3l2Q8BH52 521 aa13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Thap12Q9CUX1 758 aa13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10720D3Z1I5 223 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gja8P28236 440 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pde1cQ64338 706 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf532Q6NXK2 1036 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tubb2aQ7TMM9 445 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr151Q7TSN6 422 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8CEZ4 452 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rem2Q8VEL9 341 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MrgpreQ91ZB7 310 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tubb2bQ9CWF2 445 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scgb2b20Q9JI02 112 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DgkiD3YWQ0 1071 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Acot1O55137 419 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr25P0C5I1 358 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc10a3P21129 473 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tsta3P23591 321 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Esyt3Q5DTI8 891 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PisdQ8BSF4 406 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Creld2Q9CYA0 350 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scnn1bQ9WU38 638 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rgs2O08849 211 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stk10O55098 966 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01650 108 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01653 108 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mxi1P50540 228 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gp1bbP56400 206 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nr2e1Q64104 385 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ankrd45Q810N6 248 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf473Q8BI67 892 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tada2aQ8CHV6 443 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr356Q8VFP5 315 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc33Q9D6K7 262 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rdh14Q9ERI6 334 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CenphQ9QYM8 241 aa13.75□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TrioQ0KL02 3102 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Farp1F8VPU2 1048 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r19G5E8G4 854 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm3182K7N6T8 263 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam19O35674 920 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DffaO54786 331 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Runx2Q08775 607 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aarsd1Q3THG9 412 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vav2Q60992 868 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc117Q6PB51 277 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rad9bQ6WBX7 403 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr212Q7TS33 327 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5622Q810Q0 167 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ublcp1Q8BGR9 318 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smtnl2Q8CI12 456 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fermt3Q8K1B8 665 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpa3Q9CQ71 121 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc9bQ9D6E4 239 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Timp4Q9JHB3 224 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trpv2Q9WTR1 756 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ThadaA8C756 1938 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm13941A2AJ38 245 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TktP40142 623 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ArvcfP98203 962 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CttnQ60598 546 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Txndc8Q69AB2 127 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Map3k11Q80XI6 850 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fbxw21Q8BI38 468 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdcl3Q8BVF2 240 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pak2Q8CIN4 524 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdha11Q91Y19 950 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nme7Q9QXL8 395 aa13.74□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1023A2ASU6 311 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ptpn18Q61152 453 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aste1Q8BIR2 672 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PhykplQ8R1K4 467 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DpysQ9EQF5 519 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Birc5O70201 140 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adamts1P97857 968 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tsr1Q5SWD9 803 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam118bQ8C569 351 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Epc1Q8C9X6 813 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cuedc2Q9CXX9 284 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab13Q9DD03 202 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ggt5Q9Z2A9 573 aa13.73□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arid2E9Q7E2 1828 aa13.72□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cacna2d1O08532 1103 aa13.72□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cntn2Q61330 1040 aa13.72□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa13.72□□□□□ -0.21
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 H6pdQ8CFX1 789 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.3 ms