RNA–Protein interactions for RNA: YMR081C

ISF1, Transcript of Serine-rich, hydrophilic protein, yeast

Gene ISF1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ISF1	YMR081C	RRN5	Q02983	363 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	SGF11	Q03067	99 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	DGA1	Q08650	418 aa		0.19	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	RPB7	P34087	171 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	MPC3	P53311	146 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	NCE101	Q02820	53 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	VAM10	Q08474	114 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.18	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	AIM25	P47140	327 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	UBC12	P52491	188 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	UPS3	Q04006	179 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YDR278C	Q05612	105 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	UPS1	Q05776	175 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	ODC2	Q99297	307 aa		0.17	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	TIR1	P10863	254 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YCR001W	P25347	104 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	UBC8	P28263	218 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	HYM1	P32464	399 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	NSG1	P38837	291 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YIL102C	P40488	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	ALG13	P53178	202 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.16	□□□□□ -2.38
ISF1	YMR081C	GCN3	P14741	305 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	COG5	P53951	403 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	PET117	Q02771	107 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	BNA7	Q04066	261 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		0.15	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	COX8	P04039	78 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	AHT1	P29589	182 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YBR242W	P38331	238 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	AIM18	P38884	321 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	RTC4	P53850	401 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	FIT2	Q08906	153 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.14	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MGT1	P26188	188 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MSN4	P33749	630 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MET31	Q03081	177 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	IRC23	Q08416	157 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YNG1	Q08465	219 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	FCY1	Q12178	158 aa		0.13	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	STF2	P16965	84 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YMR31	P19955	123 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	SFK1	P35735	353 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	RNH202	Q05635	350 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	CCW12	Q12127	133 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.12	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	ARO7	P32178	256 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YAR064W	P39563	99 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YNL194C	P40169	301 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	XPT1	P47165	209 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	PDR17	P53844	350 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YDC1	Q02896	317 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YDR210W	Q03482	75 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.11	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	MIC12	P38341	106 aa		0.1	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	IRC18	P47056	224 aa		0.1	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	DYN3	Q04949	312 aa		0.1	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	FYV12	Q08559	129 aa		0.1	□□□□□ -2.39
ISF1	YMR081C	YPK2	P18961	677 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	TRX3	P25372	127 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	DCV1	P43595	202 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	YDR102C	Q03864	110 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	SHH3	Q04487	196 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	IRC19	Q07843	230 aa		0.09	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	AIM2	P39721	246 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	YER134C	P40081	178 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	SPC1	P46965	94 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	MGA1	P53050	456 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	FIT1	Q04433	528 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.08	□□□□□ -2.4
ISF1	YMR081C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4

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