RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 GALK1P51570 392 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFRLQ15198 375 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO43Q4G163 708 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CPA6Q8N4T0 437 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PARVGQ9HBI0 331 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 GREB1Q4ZG55 1949 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLK1O15075 740 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 F11P03951 625 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR15P49685 360 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY1Q01534 308 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 RILPL1Q5EBL4 403 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM150AQ86TG1 271 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4K2AQ9BTU6 479 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB7Q9H672 318 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPC7Q9HCX4 862 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP3Q9NY33 737 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAK2O60296 914 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 APBB3O95704 486 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CAVIN2O95810 425 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CSH1P0DML2 217 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CSH2P0DML3 217 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SDHAF4Q5VUM1 108 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ADALQ6DHV7 355 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ACDQ96AP0 544 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD2Q9Y426 696 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 PROS1P07225 676 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA4P35212 333 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKEP52429 567 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DMC1Q14565 340 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MTF1Q14872 753 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SV2CQ496J9 727 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MON1AQ86VX9 555 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RIN3Q8TB24 985 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNN1Q92952 543 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CALML4Q96GE6 196 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1GO43497 2377 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CHD6Q8TD26 2715 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf47A7E2U8 309 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNAR2P48551 515 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT13Q7L8C5 426 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CD101Q93033 1021 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ECT2Q9H8V3 914 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF3AQ9Y496 699 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KPNA7A9QM74 516 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD63C9JTQ0 380 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXC1Q12948 553 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF560Q96MR9 790 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TMLHEQ9NVH6 421 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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CAPNS1-217ENST00000629983 INVSQ9Y283 1065 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TSC2P49815 1807 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TISP43B9A030 160 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC24BO95487 1268 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 UBA7P41226 1012 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TSTD1Q8NFU3 115 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT6Q9Y6F9 365 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 GIPC1O14908 333 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CKMP06732 381 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCD1P33897 745 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF131P52739 623 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM160A1Q05DH4 1040 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM6Q14566 821 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 DDR2Q16832 855 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2A3Q93084 1043 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH11P35749 1972 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP295Q9C0D2 2601 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 SOBPA7XYQ1 873 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 NEFLP07196 543 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF9P0C862 333 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 OSCP1Q8WVF1 389 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TPSD1Q9BZJ3 242 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 EBF1Q9UH73 591 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L7P0C7H9 530 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2BQ00403 316 aa29.44■■■□□ 2.3
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