RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 KLC1Q07866 573 aa9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 FAXCQ5TGI0 409 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-222ENST00000621217 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-222ENST00000621217 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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