RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SYT15Q9BQS2 421 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MOSPD3O75425 235 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CDR1P51861 262 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 VEPH1Q14D04 833 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ZNF667Q5HYK9 610 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 POTEHQ6S545 545 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PARM1Q6UWI2 310 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TAF4BQ92750 862 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 OBSL1O75147 1896 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TRIM49P0CI25 452 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TRIM49CP0CI26 452 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MYL4P12829 197 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 BMP6P22004 513 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CCNE1P24864 410 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PPP3CAQ08209 521 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ISM2Q6H9L7 571 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MCRS1Q96EZ8 462 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SNX25Q9H3E2 840 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 GTF2H1P32780 548 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CRTAC1Q9NQ79 661 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NME7Q9Y5B8 376 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ATP2C2O75185 946 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FGF19O95750 216 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 HLA-DRAP01903 254 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SRFP11831 508 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 GCLMP48507 274 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CCDC142Q17RM4 750 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 GPR88Q9GZN0 384 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PDGFRBP09619 1106 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 P4HA1P13674 534 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 CYP2F1P24903 491 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PIK3CAP42336 1068 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MAGEA11P43364 429 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 SMYD3Q9H7B4 428 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 ECI2O75521 394 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 GAREM2Q75VX8 874 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MYH10P35580 1976 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 MUC6Q6W4X9 2439 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-220ENST00000618056 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PRU2 124 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 STX10O60499 249 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GJA1P17302 382 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 KRT39Q6A163 491 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GIPC2Q8TF65 315 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MYLPFQ96A32 169 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 ASB16Q96NS5 453 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 BIN1O00499 593 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CLSTN1O94985 981 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 GABRR2P28476 465 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TEAD2Q15562 447 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TAF12Q16514 161 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 TTI2Q6NXR4 508 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 VSTM1Q6UX27 236 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 PCED1BQ96HM7 432 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 CEP63Q96MT8 703 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 KXD1Q9BQD3 176 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 IL21Q9HBE4 155 aa26.56■■□□□ 1.84
PMS1-220ENST00000618056 WNT16Q9UBV4 365 aa26.56■■□□□ 1.84
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