RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SKA1Q96BD8 255 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RMDN3Q96TC7 470 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MAFGO15525 162 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MUTP22033 750 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 VAMP7P51809 220 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GALCP54803 685 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF844Q08AG5 666 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PARP6Q2NL67 630 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL12Q53G59 568 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZBTB33Q86T24 672 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 C9orf72Q96LT7 481 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 STK33Q9BYT3 514 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CEP44Q9C0F1 390 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 IDH3BO43837 385 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PEX3P56589 373 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 S100ZQ8WXG8 99 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 OLFM1Q99784 485 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 AK5Q9Y6K8 562 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NEDD4P46934 1319 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 E9PCH4 1651 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ADCY6O43306 1168 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ATP6V1G1O75348 118 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GH2P01242 217 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HOXC6P09630 235 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PMLP29590 882 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CHI3L2Q15782 390 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TTMPQ5BVD1 217 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SYNE4Q8N205 404 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 APPL1Q9UKG1 709 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EVPLLA8MZ36 301 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PSTPIP1O43586 416 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EFCAB14O75071 495 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MMP10P09238 476 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MYL2P10916 166 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 FCER1AP12319 257 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EPHB2P29323 1055 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 STAT3P40763 770 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NUDT2P50583 147 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TUBA3CQ13748 450 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SUN5Q8TC36 379 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RMDN1Q96DB5 314 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 IPPQ9Y573 584 aa7.16□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 VAV1P15498 845 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PTK2BQ14289 1009 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 P3H2Q8IVL5 708 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 VPS33BQ9H267 617 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PARVAQ9NVD7 372 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NYAP2Q9P242 653 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SOX13Q9UN79 622 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MEIS1O00470 390 aa7.15□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CYP27B1O15528 508 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms