RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZACNQ401N2 412 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZNF677Q86XU0 584 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 M0QYV0 167 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ATP5HO75947 161 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 HSD17B4P51659 736 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TNFAIP1Q13829 316 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 C7orf31Q8N865 590 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ABCA3Q99758 1704 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MTA2O94776 668 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 DESP17661 470 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 POLE2P56282 527 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 RCN1Q15293 331 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 WLSQ5T9L3 541 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CHKBQ9Y259 395 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 WNT10BO00744 389 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 BMPR2Q13873 1038 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ZBED1O96006 694 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SERPINB3P29508 390 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 WNT7BP56706 349 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MAPK6Q16659 721 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MRIQ9BWK5 157 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SENP1Q9P0U3 644 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PRPSAP2O60256 369 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PYGBP11216 843 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 IVDP26440 423 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MON1BQ7L1V2 547 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 LPAR1Q92633 364 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CDHR1Q96JP9 859 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 KCNN4O15554 427 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 AVILO75366 819 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 GLRA2P23416 452 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 STXBP2Q15833 593 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 NPNTQ6UXI9 565 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 TRIM50Q86XT4 487 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 POLIQ9UNA4 740 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PTPRJQ12913 1337 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 H3BRJ5 948 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ELK3P41970 407 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PTGER2P43116 358 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CNTN2Q02246 1040 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MORF4L2Q15014 288 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 LGSNQ5TDP6 509 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 ACAP3Q96P50 834 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 MIS12Q9H081 205 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 STK32BQ9NY57 414 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-215ENST00000613394 B2RBV5 119 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms