RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LOXL4Q96JB6 756 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF560Q96MR9 790 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EBF3Q9H4W6 596 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TDP1Q9NUW8 608 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.11□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SOBPA7XYQ1 873 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 AXIN1O15169 862 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG13O75143 517 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R37O75864 691 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 IL18RAPO95256 599 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ADSSP30520 456 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 DDIT3P35638 169 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP1GAPP47736 663 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR15P49685 360 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LIMK1P53667 647 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 POSTNQ15063 836 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNDC8Q6A555 127 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SFR1Q86XK3 245 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 STKLD1Q8NE28 680 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RIN3Q8TB24 985 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 HVCN1Q96D96 273 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF40O75150 1001 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TADA3O75528 432 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EPN2O95208 641 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 EGFP01133 1207 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF806P0C7X5 589 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CSH1P0DML2 217 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CSH2P0DML3 217 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC192P0DO97 292 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ARSAP15289 507 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PNPLA4P41247 253 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT7BP56706 349 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 AMPD2Q01433 879 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPY1Q01534 308 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC6Q16204 474 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 IL31Q6EBC2 164 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 BRAPQ7Z569 592 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 KBTBD6Q86V97 674 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MON1AQ86VX9 555 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ACBD6Q9BR61 282 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 STRA6Q9BX79 667 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCB6Q9NP58 842 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TM4SF5O14894 197 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP3O75969 853 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NOL4O94818 638 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGB3P05106 788 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DRD1P21728 446 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GJA4P35212 333 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GALK1P51570 392 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNA1Q09470 495 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PDGFRLQ15198 375 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ST3GAL2Q16842 350 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO43Q4G163 708 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DYMQ7RTS9 669 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EPSTI1Q96J88 318 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MYRFLQ96LU7 910 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms