RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATF6	P18850	670 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GABRR2	P28476	465 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	VIPR2	P41587	438 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PFKP	Q01813	784 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMD6	Q15008	389 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	SHD	Q96IW2	340 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.27	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.27	□□□□□ -0.28
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PQ27	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PQ64	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PQD8	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHACTR2	O75167	634 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYL1	P05976	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FCAR	P24071	287 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	LHX1	P48742	406 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASP4	P49662	377 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR15	P49685	360 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRPC3	Q13507	836 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP2C2	O75185	946 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF202	O95125	648 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGF19	O95750	216 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMC3	P17980	439 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD72	P21854	359 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP2F1	P24903	491 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCSK1	P29120	753 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GDI1	P31150	447 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	STARD6	P59095	220 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NUCB2	P80303	420 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP4F8	P98187	520 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	BIRC3	Q13489	604 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPYSL4	O14531	572 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	GABRD	O14764	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF263	O14978	683 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRN2	O75325	713 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	NR3C1	P04150	777 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	LMO2	P25791	158 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNNC1	P63316	161 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.25	□□□□□ -0.29

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