RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTPRS-209	ENST00000591760	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRS-209	ENST00000591760	PHACTR2	O75167	634 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	PSMC3	P17980	439 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ATIC	P31939	592 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CASP4	P49662	377 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GRM2	Q14416	872 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF516	Q92618	1163 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	DNASE1L2	Q92874	299 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SYT15	Q9BQS2	421 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CDH9	Q9ULB4	789 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CLDN10	P78369	228 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	BIRC3	Q13489	604 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	VIT	Q6UXI7	678 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	BRD9	Q9H8M2	597 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	HCRT	O43612	131 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TACC1	O75410	805 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	VIPR2	P41587	438 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MYL6	P60660	151 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GPR158	Q5T848	1215 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP135	Q66GS9	1140 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM171B	Q6P995	826 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	PJA1	Q8NG27	643 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	IRF7	Q92985	503 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	SNX25	Q9H3E2	840 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	IL21	Q9HBE4	155 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM163B	P0C2L3	166 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CSH1	P0DML2	217 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CSH2	P0DML3	217 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP2F1	P24903	491 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	LMO2	P25791	158 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	NFIL3	Q16649	462 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760		H0Y858	1186 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CLSTN1	O94985	981 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	NR2F2	P24468	414 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GPR15	P49685	360 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC142	Q17RM4	750 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TMC2	Q8TDI7	906 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FOXQ1	Q9C009	403 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TASP1	Q9H6P5	420 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	RMND1	Q9NWS8	449 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAPK13	O15264	365 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GDI1	P31150	447 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAGEA11	P43364	429 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP4F8	P98187	520 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	NCOA4	Q13772	614 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	DDR2	Q16832	855 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF699	Q32M78	642 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	YAF2	Q8IY57	180 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MYLPF	Q96A32	169 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRS-209	ENST00000591760	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2

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