RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 SYT15Q9BQS2 421 aa21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
UBXN6-206ENST00000590466 CETN3O15182 167 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PDGFRBP09619 1106 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM49P0CI25 452 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM49CP0CI26 452 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GJA1P17302 382 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TNNC1P63316 161 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF699Q32M78 642 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 KRT13P13646 458 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 CCNE1P24864 410 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 CYP2F1P24903 491 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GCLMP48507 274 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC63Q05C16 580 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GAREM2Q75VX8 874 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 MTSS1LQ765P7 747 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ITIH5Q86UX2 942 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 IL21Q9HBE4 155 aa21.63■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 HLA-DRAP01903 254 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SRFP11831 508 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 COL9A1P20849 921 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FCARP24071 287 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GPR15P49685 360 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 CDH8P55286 799 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 VEPH1Q14D04 833 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TEAD2Q15562 447 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GIPC2Q8TF65 315 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TAF4BQ92750 862 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TSG101Q99816 390 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SDCBP2Q9H190 292 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SNX25Q9H3E2 840 aa21.62■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 A0A1W2PRU2 124 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 BIN1O00499 593 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PSMA7O14818 248 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ECI2O75521 394 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GTF2H1P32780 548 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PPP1R2P41236 205 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 MAGEA11P43364 429 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GPR152Q8TDT2 470 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ASB16Q96NS5 453 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.61■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 STIM1Q13586 685 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 DDR2Q16832 855 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TTI2Q6NXR4 508 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FBXL6Q8N531 539 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 MYLPFQ96A32 169 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PCED1BQ96HM7 432 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 KXD1Q9BQD3 176 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 WNT16Q9UBV4 365 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.6■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 LRRN2O75325 713 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 FGF19O95750 216 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 GABRR2P28476 465 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 PIK3CAP42336 1068 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 ASPAP45381 313 aa21.59■■□□□ 1.05
UBXN6-206ENST00000590466 RAP1GAPP47736 663 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms