RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PSMC3P17980 439 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CDC25CP30307 473 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 KCNB1Q14721 858 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TAF12Q16514 161 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 FAM171BQ6P995 826 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 VITQ6UXI7 678 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 IL21Q9HBE4 155 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CDH9Q9ULB4 789 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PIEZO1Q92508 2521 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 H0Y858 1186 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TACC1O75410 805 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 NR3C1P04150 777 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 WEE1P30291 646 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ATICP31939 592 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 VIPR2P41587 438 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TRPC3Q13507 836 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GIPC2Q8TF65 315 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 IRF7Q92985 503 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MMS19Q96T76 1030 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CSH1P0DML2 217 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CSH2P0DML3 217 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CYP2F1P24903 491 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 LMO2P25791 158 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GRM2Q14416 872 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PJA1Q8NG27 643 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TASP1Q9H6P5 420 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 BRD9Q9H8M2 597 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 HCRTO43612 131 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PHACTR2O75167 634 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MAGEA11P43364 429 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 CASP4P49662 377 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MYL6P60660 151 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 NFIL3Q16649 462 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GPR158Q5T848 1215 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TMC2Q8TDI7 906 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GCNAQ96QF7 691 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 NELL2Q99435 816 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 SYT15Q9BQS2 421 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 OBP2AQ9NY56 170 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 OBSL1O75147 1896 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRDP23468 1912 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 SOBPA7XYQ1 873 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MAPK13O15264 365 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ATP2C2O75185 946 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 F11P03951 625 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GDI1P31150 447 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MRE11P49959 708 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 TNNC1P63316 161 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 DDR2Q16832 855 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 FOXQ1Q9C009 403 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 SNX25Q9H3E2 840 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 F5P12259 2224 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 IKBKBO14920 756 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF263O14978 683 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms