RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX5P50542 639 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF12L1Q5VU92 463 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF653Q96CK0 615 aa27.01■■□□□ 1.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 AP1M1Q9BXS5 423 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYP1B1Q16678 543 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS18Q9NS28 235 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 PCYOX1Q9UHG3 505 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIM3Q96PE6 472 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 OSMRQ99650 979 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 LMAN2LQ9H0V9 348 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR182O15218 404 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLCN3P51790 818 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 POU5F1BQ06416 359 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 PTP4A2Q12974 167 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 BIRC3Q13489 604 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 TFDP1Q14186 410 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM228AQ86W67 206 aa26.97■■□□□ 1.91
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