RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 SAMD11Q96NU1 681 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN18Q99952 460 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 BCO1Q9HAY6 547 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LANCL2Q9NS86 450 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PNPOQ9NVS9 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ABCF2Q9UG63 623 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 STAP2Q9UGK3 403 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 BCORQ6W2J9 1755 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF609O15014 1411 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GTL3 188 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 YDJCA8MPS7 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 F5H423 210 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FRS3O43559 492 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH1A2O94788 518 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TSPAN15O95858 294 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MYF5P13349 255 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PRKAR2BP31323 418 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A9P48067 706 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC10P48553 1259 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MRE11P49959 708 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 WNT3AP56704 352 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PLS1Q14651 629 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF385BQ569K4 471 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ANO1Q5XXA6 986 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MCTP2Q6DN12 878 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SKAP1Q86WV1 359 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 NGEFQ8N5V2 710 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 OR7D4Q8NG98 312 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 DEPTORQ8TB45 409 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 APIPQ96GX9 242 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 NT5C1BQ96P26 610 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM140Q9NV12 185 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CPA4Q9UI42 421 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ABCC12Q96J65 1359 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf118A6NHY6 69 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RFXAPO00287 272 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MYL6BP14649 208 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 TYRP14679 529 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SREBF1P36956 1147 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3CBP42338 1070 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PRIM2P49643 509 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00310P59036 64 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LPPQ93052 612 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 PHKBQ93100 1093 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 SGCZQ96LD1 299 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 LDAHQ9H6V9 325 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 RSAD1Q9HA92 442 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 FNIP2Q9P278 1114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 H0YGN5 161 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KPNA5O15131 536 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 KCNQ3O43525 872 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 GASTP01350 101 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-208ENST00000578600 MALP21145 153 aa6.42□□□□□ -1.38
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