RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	PIK3CA	P42336	1068 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	FAM171B	Q6P995	826 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		18.85	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	BIN1	O00499	593 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-DRA	P01903	254 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	PDGFRB	P09619	1106 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	ATF6	P18850	670 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	CCR2	P41597	374 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	GCLM	P48507	274 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	CDR1	P51861	262 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	PPP3CA	Q08209	521 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	ASIC4	Q96FT7	647 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		18.84	■□□□□ 0.61
ATG13-223	ENST00000577256	BICDL2	A1A5D9	508 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ATP2C2	O75185	946 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	BMP6	P22004	513 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TAF12	Q16514	161 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	KRT39	Q6A163	491 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PARM1	Q6UWI2	310 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	FGF14	Q92915	247 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GBP4	Q96PP9	640 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GPR88	Q9GZN0	384 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256		A8MXQ7	604 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MOSPD3	O75425	235 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SRF	P11831	508 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CYP2F1	P24903	491 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MAGEA11	P43364	429 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CAMK4	Q16566	473 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC142	Q17RM4	750 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NELFB	Q8WX92	580 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PTPRD	P23468	1912 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1W2PRU2	124 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CSH1	P0DML2	217 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CSH2	P0DML3	217 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GJA1	P17302	382 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CDC25C	P30307	473 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	MXI1	P50539	228 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TEAD2	Q15562	447 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TTI2	Q6NXR4	508 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	VSTM1	Q6UX27	236 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NME7	Q9Y5B8	376 aa		18.81	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	ECI2	O75521	394 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	GABRR2	P28476	465 aa		18.8	■□□□□ 0.6
ATG13-223	ENST00000577256	CDH8	P55286	799 aa		18.8	■□□□□ 0.6

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