RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 LEMD2Q8NC56 503 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TMC2Q8TDI7 906 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM209Q96SK2 561 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CORO1BQ9BR76 489 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 L1RE1Q9UN81 338 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 NOTCH4Q99466 2003 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 BIN1O00499 593 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 MAN2B1O00754 1011 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SEC24AO95486 1093 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT19P08727 400 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 OR4Q2P0C623 313 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ARPP19P56211 112 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 BFSP1Q12934 665 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM9Q13443 819 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 USP37Q86T82 979 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 HPDLQ96IR7 371 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 OR6C75A6NL08 312 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 VNN1O95497 513 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CEBPBP17676 345 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ADCY1Q08828 1119 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 IRF7Q92985 503 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DSEQ9UL01 958 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.49■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CD72P21854 359 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SDHBP21912 280 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNE1P24864 410 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR17Q13304 367 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 OSTM1Q86WC4 334 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 RMDN1Q96DB5 314 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 IER2Q9BTL4 223 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 BRD9Q9H8M2 597 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 VAMP7P51809 220 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 MYL6P60660 151 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ENPEPQ07075 957 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2R5DQ14738 602 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ZACNQ401N2 412 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GPT2Q8TD30 523 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 E2F7Q96AV8 911 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GBP4Q96PP9 640 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR88Q9GZN0 384 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 NCDNQ9UBB6 729 aa21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 GABRDO14764 452 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 IKBKBO14920 756 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM49P0CI25 452 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM49CP0CI26 452 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 CPB1P15086 417 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 AP3M2P53677 418 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC63Q05C16 580 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP3CAQ08209 521 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-210ENST00000559586 TTI2Q6NXR4 508 aa21.46■■□□□ 1.03
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