RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	KIF20A	O95235	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ENG	P17813	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2C19	P33261	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	LIPA	P38571	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC41	Q15345	812 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843		Q4G0T1	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	BCAR3	O75815	825 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF134	P52741	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ACAP2	Q15057	778 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MYMK	A6NI61	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843		E5RJQ4	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SOCS2	O14508	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	RARB	P10826	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CCKAR	P32238	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00205	P59089	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TCF15	Q12870	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NRAC	Q8N912	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	RITA1	Q96K30	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TLR5	O60602	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PHKA1	P46020	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MIDN	Q504T8	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NPS	P0C0P6	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	KIF22	Q14807	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ICE2	Q659A1	982 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	COA7	Q96BR5	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NELL2	Q99435	816 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843		M0QYG6	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	MT-CO1	P00395	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PRDX5	P30044	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	SP2	Q02086	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COPS2-205	ENST00000558843	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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