RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CDH7Q9ULB5 785 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PMM2O15305 246 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 VNN1O95497 513 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 RHOP08100 348 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 BMP6P22004 513 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ANXA13P27216 316 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEA11P43364 429 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 NLRP12P59046 1061 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPN21Q16825 1174 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB20Q9NX57 234 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM66O15016 1216 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CSH1P0DML2 217 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CSH2P0DML3 217 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 LAMP2P13473 410 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CDC25CP30307 473 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 EPHA5P54756 1037 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP3CAQ08209 521 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM171BQ6P995 826 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 OSTM1Q86WC4 334 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM84AQ96KN4 292 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM209Q96SK2 561 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 CDH22Q9UJ99 828 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRDP23468 1912 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SOBPA7XYQ1 873 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35C1Q96A29 364 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 E2F7Q96AV8 911 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 BCO2Q9BYV7 579 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO10Q9HD67 2058 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MUC3AQ02505 3323 aa16.83■□□□□ 0.29
RABGGTA-205ENST00000558534 PDGFRBP09619 1106 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MYH10P35580 1976 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 STX17P56962 302 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP27A1Q02318 531 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 TDGQ13569 410 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 FGF13Q92913 245 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM81BQ96LP2 452 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PKMYT1Q99640 499 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 CD320Q9NPF0 282 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP72Q9P209 647 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 NOTCH4Q99466 2003 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 VNN2O95498 520 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MYL4P12829 197 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 LMO2P25791 158 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 ASPAP45381 313 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 FMO5P49326 533 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PDE6CP51160 858 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 INCA1Q0VD86 236 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS36Q5K4E3 855 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 EDAQ92838 391 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 MYLPFQ96A32 169 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA17Q96L03 361 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms