RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 OBP2AQ9NY56 170 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.32■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SHISA7A6NL88 538 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CLIC2O15247 247 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CSH1P0DML2 217 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CSH2P0DML3 217 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TNNI1P19237 187 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 GPR15P49685 360 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CYP2J2P51589 502 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PKP1Q13835 747 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 WDR49Q8IV35 697 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SPATA18Q8TC71 538 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MSANTD3Q96H12 275 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 UBE4BO95155 1302 aa23.31■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ARNTLO00327 626 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CYP2F1P24903 491 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 AVPR1AP37288 418 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MTAPQ13126 283 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 FZD5Q13467 585 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 RESP18Q5W5W9 173 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 OSTM1Q86WC4 334 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TTC8Q8TAM2 541 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MMS19Q96T76 1030 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ABCB6Q9NP58 842 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PTPRJQ12913 1337 aa23.3■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TCHHQ07283 1943 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TGFB1I1O43294 461 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PRAMEF12O95522 483 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 WEE1P30291 646 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 NLRP12P59046 1061 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PPP2R5DQ14738 602 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 DDR2Q16832 855 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 DPH6Q7L8W6 267 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 STKLD1Q8NE28 680 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CHRDQ9H2X0 955 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.29■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 GABRDO14764 452 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SOX9P48436 509 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PLCB2Q00722 1185 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CUL4BQ13620 913 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TSSK4Q6SA08 328 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa23.28■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 HCRTO43612 131 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 F11P03951 625 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 LRRC32Q14392 662 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SYT15Q9BQS2 421 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 IER2Q9BTL4 223 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 CDH9Q9ULB4 789 aa23.27■■□□□ 1.32
CIPC-208ENST00000557115 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CIPC-208ENST00000557115 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.26■■□□□ 1.31
CIPC-208ENST00000557115 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.26■■□□□ 1.31
CIPC-208ENST00000557115 PDGFRBP09619 1106 aa23.26■■□□□ 1.31
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