RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554070.1

AREL1-208, Transcript of apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene AREL1, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AREL1-208	ENST00000554070	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	F5	P12259	2224 aa		12.52	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	HCRT	O43612	131 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	LILRB5	O75023	590 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	F11	P03951	625 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	WEE1	P30291	646 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ID4	P47928	161 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	NLRP12	P59046	1061 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	AMPD3	Q01432	767 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	GAS6	Q14393	721 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	GABRD	O14764	452 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CSH1	P0DML2	217 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CSH2	P0DML3	217 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TDGF1	P13385	188 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CYP2F1	P24903	491 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CASP1	P29466	404 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CTH	P32929	405 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MYL7	Q01449	175 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TNK2	Q07912	1038 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SURF1	Q15526	300 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	DDR2	Q16832	855 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	HPDL	Q96IR7	371 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	IER2	Q9BTL4	223 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CCL26	Q9Y258	94 aa		12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TGFB1I1	O43294	461 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ATP2C2	O75185	946 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	F13A1	P00488	732 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TNNC2	P02585	160 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	LMO2	P25791	158 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	PCSK1	P29120	753 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CXCL12	P48061	93 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	LHX1	P48742	406 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	CCR3	P51677	355 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	PLCB2	Q00722	1185 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SATB1	Q01826	763 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	EHHADH	Q08426	723 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	MYO1E	Q12965	1108 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	PON2	Q15165	354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	TXNDC8	Q6A555	127 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	GKN1	Q9NS71	199 aa		12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
AREL1-208	ENST00000554070	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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